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インプラントで医療費控除はいくら戻る?計算例と確定申告の手順を解説

インプラントの医療費控除はいくら戻るのか、課税所得別の還付額シミュレーションと確定申告の手順を国税庁の情報をもとに解説。糸島で費用負担を抑えたい方へ。

インプラント治療は自由診療のため、治療内容によって費用は異なります。
比較的高額な治療であることから、費用負担が気になる方も少なくありません。 


実際にインプラント治療のご相談では、
『医療費控除を利用すると、実際にどのくらい負担が軽減されるのでしょうか』
というご質問をいただくことがあります。


実は、支払った治療費の一部は「医療費控除」によって、
税金の還付や軽減という形で戻ってくる可能性があります。

たとえば医療費控除額が40万円になるケースでは、課税所得に応じて所得税と住民税をあわせ、
おおよそ6万〜17万円程度の税負担軽減ができることもあります。


そこで本記事では、インプラントの医療費控除がいくら戻るのかを課税所得別のシミュレーションで示しながら、対象になる費用や確定申告の手順まで、国税庁の情報をもとにわかりやすく解説します。

目次

インプラントの治療費は医療費控除の対象になる

結論からお伝えすると、
インプラント治療は基本的に保険適用外(自由診療)ですが、医療費控除の対象になります。


失った歯の噛む機能を回復する目的の治療であれば、自由診療であっても申告に含められるためです。


国税庁も、医師または歯科医師による診療・治療の対価を控除の対象として示しています。
インプラント治療は自由診療のため、治療内容や本数、お口の状態によって費用は異なります。

当院では、インプラント治療(1歯あたり)の費用は483,000円~637,000円(税込)を目安としてご案内しています。
治療内容や症例によって費用・治療期間は異なるため、詳しくは診査・診断のうえで個別にご案内しています。

比較的高額になりやすい治療だからこそ、医療費控除を活用することで税負担を軽減できる場合があります。

当院のインプラントの費用については、自費診療価格ページでもご確認をいただけます。


①対象になる費用・ならない費用の見分け方

ただし、すべての歯科治療費が対象になるわけではありません。
判断のポイントは「治療を目的としているかどうか」です。

見た目の美しさだけを目的とした処置は、
医療費控除の対象外と扱われる場合があります。


対象に含められる主な費用は、次のとおりです。

  • インプラントの手術費・人工歯根・上部構造の費用
  • CT撮影などの検査・診断にかかる費用
  • 通院のための交通費(電車・バスなど公共交通機関)
  • 生計を一にする家族が同じ年に支払った医療費


反対に、次のような費用は対象に含められないことが多いため、
注意したいところです。

  • 美容・審美のみを目的としたホワイトニング
  • 自家用車のガソリン代や駐車場代
  • インプラントと直接関係のないサプリメント代

出典:国税庁「No.1122 医療費控除の対象となる医療費」

インプラントの医療費控除はいくら戻る?計算式とシミュレーション

「医療費控除でいくら戻るのか」は、

①医療費控除額を求める
②控除額に税率をかける、という2つのステップで概算できます。


順番に見ていきましょう。


ステップ1:医療費控除額の計算式

医療費控除額は、1年間に支払った医療費から、
保険金などで補填される金額と10万円を差し引いて求めます。


式にすると次のようになります。


(1年間に支払った医療費 − 保険金などで補填される金額)− 10万円
= 医療費控除額

その年の総所得金額等が200万円未満の方は、10万円ではなく総所得金額等の5%を差し引きます。
控除額の上限は200万円です。

出典:国税庁「No.1120 医療費を支払ったとき(医療費控除)」


ステップ2:還付・軽減される税額と課税所得別シミュレーション

求めた控除額に所得税率(5〜45%)をかけた金額が、所得税の還付の目安です。
あわせて、控除額の約10%にあたる住民税が、翌年度に軽減されます。


ここでは、治療費と交通費をあわせて年間50万円を支払い、
医療費控除額が40万円(50万円−10万円)になったケースで試算してみましょう。

なお税率は年収ではなく、所得控除を差し引いた後の課税所得によって決まります。

課税所得金額所得税率所得税の還付(目安)住民税の軽減(目安)合計(目安)
195万円以下5%2万円4万円約6万円
195万〜330万円10%4万円4万円約8万円
330万〜695万円20%8万円4万円約12万円
695万〜900万円23%9.2万円4万円約13.2万円
900万〜1,800万円33%13.2万円4万円約17.2万円

出典:国税庁「No.1120」「No.2260 所得税の税率」をもとに、医療費控除額40万円(治療費等50万円−10万円)で試算。※住民税の軽減額は所得割額を基準とした概算です。。復興特別所得税や他の控除は考慮しない概算で、実際の金額には個人差があります。

出典:国税庁「No.2260 所得税の税率」

費用の総額や負担を抑える方法については、『インプラントの費用はなぜ高い?総額・分割・医療費控除まで徹底解説』もあわせてご覧ください。

確定申告で医療費控除を受ける手順

会社員の方からは『年末調整で済むのでは?』というご質問をいただきますが、
医療費控除は年末調整では手続きできません。

会社員の方も、ご自身で確定申告を行う必要があります。
難しく感じるかもしれませんが、流れを押さえれば手続きはシンプルです。

①準備するもの・必要書類

  • 医療費控除の明細書(国税庁サイトで入手可能)
  • 源泉徴収票(給与所得者の場合)
  • 治療費・交通費の領収書(提出は不要・自宅で5年間保管)
  • マイナンバーカードなど本人確認書類
  • 還付金の振込先がわかる口座情報


領収書は申告時の提出こそ不要ですが、自宅で5年間保管しておく必要があります。
自由診療のインプラント費用は、
通常「医療費のお知らせ」の対象外となるため、領収書の保管が特に大切です。

出典:国税庁「医療費控除を受ける方へ(確定申告特集)」


②申告の流れとe-Taxの活用

申告は、次のステップで進めます。

  • 1年間の医療費を集計し、医療費控除の明細書に記入する
  • 確定申告書を作成する(給与所得者は源泉徴収票を参照)
  • 税務署へ持参・郵送、またはe-Taxで提出する


e-Taxを使えば自宅から申告でき、マイナポータル連携を利用すると、医療費通知の情報を申告書に自動入力することも可能です。

医療費控除で損をしないための注意点

①デンタルローン・分割払いの扱い

デンタルローンでインプラント費用を支払った場合も、医療費控除の対象になります。


デンタルローンでは信販会社が歯科医院に立て替え払いをするため、その立て替えが行われた年に、
手数料を除いた治療費の全額がまとめて控除の対象です。

ローンの返済を翌年以降に分けても、対象年は立て替えが行われた年になります。


ただし、金利や手数料の部分は治療の対価ではないため、控除には含められません。
一方、ローンを使わず医院への分割払いなどでご自身が年をまたいで支払う場合は、その年に実際に支払った金額を、
それぞれの年に分けて申告します。


②高額療養費制度との違い・家族合算・さかのぼり申告

高額療養費制度は保険診療を対象とする制度のため、
自由診療であるインプラントは原則として対象外です。


一方の医療費控除は、家族の医療費も合算でき、
所得税率の高い方が申告すると還付額が大きくなる傾向があります。

申告を忘れていた場合も、還付申告として5年前までさかのぼって申告できるとされています。
過去にインプラント治療を受けて申告していない方も、一度確認してみてはいかがでしょうか。

保険適用の条件や高額療養費制度との関係は、『インプラントに保険は使える?2026年最新版』で詳しく解説しています。

糸島でインプラントの費用相談をお考えの方へ

医療費控除を活用すると、インプラント治療の実質的な負担を抑えられる場合があります。

とはいえ、総額や控除でいくら戻るかは、お口の状態や本数、所得によって変わります。


いとしま総合歯科インプラントクリニックでは、治療内容と費用の目安を丁寧にご説明しています。費用面のご不安も含めて、まずはお気軽にご相談ください。

▶ 当院のインプラント治療の内容・流れは、インプラント診療ページをご覧ください。

まとめ|インプラントの医療費控除を活用して費用負担を抑える

インプラント治療は自由診療ですが、噛む機能の回復を目的とする場合は医療費控除の対象になります。要点を整理しておきましょう。

  • 控除額=(年間医療費−保険金等)−10万円(総所得200万円未満は総所得の5%)
  • 還付の目安=控除額×所得税率、住民税は約10%が軽減される
  • 申告には確定申告が必要で、領収書は5年間の保管が必要
  • デンタルローン払いも対象、家族合算・5年さかのぼりも可能


費用だけで判断せず、控除の活用も含めて検討することが、
納得のいく治療選びにつながります。


気になる点は、診査・診断のうえで個別にご確認いただけます。


インプラント治療(自由診療)についてのご説明

✅インプラント治療は自由診療で、保険適用外・全額自己負担となります。
✅費用・治療期間・通院回数は症例によって異なり、効果には個人差があります。
✅費用や回数の詳細は、受診時に個別にご案内します。
✅外科処置を伴うため、腫れ・痛み・出血・感染・神経損傷・インプラント周囲炎などのリスクが考えられます。
✅治療の可否は、診査・診断のうえで判断します。

この記事の監修者

いとしま総合歯科インプラントクリニック
院長 星元 健佑(歯科医師)  

■監修者コメント  

私が診療において常に心がけているのは、「自分の家族だったらどの治療を選択するか」という視点です。  
治療法については、可能な選択肢のメリット・デメリットを丁寧にご説明し、そのうえで適切と考えられる治療をご提案いたします。  最終的な判断は患者様ご自身に委ねており、考えを押し付けることはありません。  

また、自由診療のみを勧めることもなく、費用面のご不安にも配慮した診療を行っています。  
当院では、定期的な勉強会やスタッフ教育を通じて医療の質向上に努めるとともに、歯科用CTや口腔内スキャナーを活用し、診断や治療計画に役立てています。  

お口のことでお悩みの方は、お気軽にご相談ください。  

■略歴  
2016年 長崎大学歯学部 卒業  
2017年 鹿児島大学にて臨床研修修了(口腔外科領域を中心に研鑽)  
2018年 オパールデンタルクリニックで特にインプラントやセラミック治療の技術を習得  
2022年 カナダへ単身で赴任  
帰国後 九州の複数の歯科診療所に勤務  
2024年 いとしま総合歯科インプラントクリニック 院長就任